Formen des Lebens. Philosophische Dimensionen der aktuellen biomedizinischen Forschung
Team:
Prof. Dr. Barry Smith, Universität des Saarlandes, IFOMIS - Institut für formale Ontologie und medizinische Informationswissenschaften
Prof. Dr. Heinz Sass, Universität Leipzig, Lehrstuhl für Genetik, Institut für Biologie II
Prof. Dr. Pirmin Stekeler-Weithofer, Universität Leipzig, Lehrstuhl für Theoretische Philosophie
Die Anwendung neuer informationstechnischer Mittel in der biomedizinischen Forschung und die damit verbundene, kontinuierlich zunehmende Datenflut erfordern ein konsequentes Nachdenken darüber, wie biologische Daten klassifiziert und integriert werden können. Dazu bedarf es robuster und sachadäquater Grundbegriffe wie Art, Spezies, Teil, Ganzes, Funktion, Prozess, Fragment, usw. Solche Begriffe gehören zum impliziten Wissen jedes Biologen.
Computergestützte Informationssysteme bedürfen nun explizit formulierter Theorien und Definitionen. Sie bereitzustellen, ist eine Aufgabe der Philosophie, die in diesem Sinne eine wichtige Vermittlerrolle zwischen Biologie und Informatik übernehmen kann und muss.
Im Projekt “Formen des Lebens” haben Philosophen, Biologen sowie Bio- und Medizininformatiker daran gearbeitet, eine philosophisch begründete, umfassende Gesamttheorie der wichtigsten Grundbegriffe der biomedizinischen Forschung zu formulieren. Diese Theorie soll als Grundlage für neue Strategien zur Organisation und Integration von Informationen im Bereich der biomedizinischen Informatik dienen und dadurch auch einen Beweis für die praktische Anwendbarkeit der gegenwärtigen Philosophie erbringen.
Publikationen
http://www.ifomis.org/ifomis.php?menu=researchPeter Heuer, Art, Gattung, System. Alber Verlag Freiburg 2007.
Boris Hennig, The Four Causes. Habilschrift Leipzig 2010; als Aufsatz: Boris Hennig, "The Four Causes" The Journal of Philosophy, 2009, 137-160.
Ludger Jansen, ed., Biomedizinische Ontologie. Zürich: VDF Hochschulverlag 2008.
Katherine Munn and Barry Smith, eds., Applied Ontology. An Introduction, Ontos Verlag 2008.
www.biospektrum.de/blatt/d_bs_pdf&_id=932517 Heinz Sass, „hsp82-neo-Mutagenese und Gene-Trapping in D. melanogaster“. Biospektrum, 2006, 12 (7), 740-742.
Barry Smith et al., „Relations in Biomedical Ontologies,“ Genome Biology 2005, R46.